序號(hào)

技術(shù)和性能參數(shù)名稱

招標(biāo)參數(shù)和性能要求

備注

1

潛在膽汁淤積相關(guān)mRNAs、lncRNAs、circRNAs檢測(cè)

27例臨床膽汁淤積樣本（肝、腸、PBMC）的差異性表達(dá)基因檢測(cè)

小于5500元/例

1.1

技術(shù)方法要求

1.Affymetrix  WT系列芯片進(jìn)行目的基因檢測(cè)；

2.單個(gè)檢測(cè)體系能夠同時(shí)實(shí)現(xiàn)mRNAs、lncRNAs和circRNAs檢測(cè)。

1.2

技術(shù)參數(shù)要求

*1.RNA用量 <1μg/sample；

*2.探針＞670萬個(gè)，檢測(cè)基因>13.4萬個(gè)，轉(zhuǎn)錄本＞54萬個(gè)；其中circRNAs＞1.2萬個(gè)；

*3.敏感度≥1.5pM；

*4.技術(shù)重復(fù)性相關(guān)系數(shù)≥0.9；

*5.準(zhǔn)確性≥0.99。

1.3

技術(shù)平臺(tái)要求

1.Affymetrix芯片平臺(tái)；

2.有經(jīng)驗(yàn)豐富的生物信息學(xué)分析團(tuán)隊(duì)；

3.公司是Affymetrix公司授權(quán)認(rèn)證服務(wù)商，具有該項(xiàng)技術(shù)檢測(cè)能力；

4.有嚴(yán)格的流程管理及質(zhì)量控制。

1.4

實(shí)驗(yàn)周期

*27個(gè)樣本檢測(cè) / 15個(gè)工作日。

2

潛在膽汁淤積相關(guān)miRNAs檢測(cè)

27例臨床膽汁淤積樣本（肝、腸、PBMC）的差異性表達(dá)基因檢測(cè)

小于4500元/例

2.1

技術(shù)方法要求

1.Agilent Human miRNA V21.0芯片進(jìn)行目的基因的檢測(cè)；

2.單個(gè)檢測(cè)體系能能區(qū)分成熟和前體miRNA，可檢測(cè)成熟miRNA。

2.2

技術(shù)參數(shù)要求

*1.RNA用量 <1μg/sample；

*2.探針含量為60K，檢測(cè)成熟miRNAs>2500個(gè)； 

*3.寬的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍，檢測(cè)豐度跨5個(gè)log，有利于檢測(cè)到更寬豐度范圍的miRNA；

*4.高重復(fù)探針，每個(gè)miRNA至少重復(fù)20次；

*5.敏感度≥0.1amol；

*6.平均CV<10%，R2?0.99；

*7.不需要分離miRNA，避免丟失及引起誤差。

2.3

技術(shù)平臺(tái)要求

1.Agilent芯片平臺(tái)；

2.有經(jīng)驗(yàn)豐富的生物信息學(xué)分析團(tuán)隊(duì)；

3.公司是Agilent公司授權(quán)認(rèn)證服務(wù)商，具有該項(xiàng)技術(shù)檢測(cè)能力；

4.有嚴(yán)格的流程管理及質(zhì)量控制。

2.4

實(shí)驗(yàn)周期

*27個(gè)樣本檢測(cè) / 15個(gè)工作日。

3

協(xié)商分析內(nèi)容

常規(guī)分析+高級(jí)分析+個(gè)性化分析

小于30000元

3.1

技術(shù)方法要求

1.具有芯片數(shù)據(jù)處理分析常規(guī)軟件編輯和應(yīng)用分析基礎(chǔ)，如：Feature Extraction，Genespring，

Affymetrix Expression console，

Transciptome Analysis Console，MultiExperiment Viewer（MEV），Cytoscape，

python編程等 ；

2.分析疾病組和健康組不同組織部位（肝、腸、PBMC）的差異性基因,篩選膽汁淤積致病的關(guān)鍵基因并分析其作用機(jī)制。

3.2

技術(shù)參數(shù)要求

*1. miRNA、lncRNA、mRNA常規(guī)分析；

*2. ceRNA高級(jí)分析（lncRNA-miRNA-mRNA）≥4次；

*3. lncRNA功能預(yù)測(cè)高級(jí)分析（cis和trans分析）≥4次；

*4. STC分析1次；

*5. WGCNA分析（結(jié)合表型數(shù)據(jù)、16S數(shù)據(jù)）：表型數(shù)據(jù)一次性提供，分析1次；

*6. GO network、Pathway network：1次。

3.3

技術(shù)平臺(tái)要求

*1.公司是Affymetrix和Agilent公司雙授權(quán)認(rèn)證服務(wù)商，具有該類技術(shù)檢測(cè)和分析能力；

*2.有經(jīng)驗(yàn)豐富的生物信息學(xué)分析團(tuán)隊(duì)；

*3.有嚴(yán)格的流程管理及質(zhì)量控制；

*4.售后服務(wù)持續(xù)到文章發(fā)表；

*5.需要配備專門的技術(shù)支持，在當(dāng)?shù)靥峁┦酆蠓��?wù)。

*6.售后服務(wù)1工作日相應(yīng)。

3.4

實(shí)驗(yàn)周期

常規(guī)分析+高級(jí)分析：2個(gè)月；個(gè)性化分析：待定。

特別說明：因本項(xiàng)目產(chǎn)生的數(shù)據(jù)將用于膽汁淤積產(chǎn)生機(jī)制分析等高端技術(shù)，所有的檢測(cè)及分析項(xiàng)目必須與同一公司合作。